Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms