Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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