Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms