Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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