Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms