Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BHMTQ93088 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BHMTQ93088 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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