Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBXN4Q92575 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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