Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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