Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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ZNF239Q16600 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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