Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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