Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
NCOA1Q15788 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NCOA1Q15788 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms