Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC0.96□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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