Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NME3Q13232 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms