Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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IFT88Q13099 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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IFT88Q13099 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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IFT88Q13099 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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IFT88Q13099 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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IFT88Q13099 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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