Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
BPTFQ12830 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms