Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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C9orf135Q5VTT2 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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C9orf135Q5VTT2 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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C9orf135Q5VTT2 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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C9orf135Q5VTT2 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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C9orf135Q5VTT2 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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