Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SCN9AQ15858 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
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SCN9AQ15858 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SCN9AQ15858 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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SCN9AQ15858 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SCN9AQ15858 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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SCN9AQ15858 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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