Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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HERC1Q15751 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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HERC1Q15751 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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HERC1Q15751 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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HERC1Q15751 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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HERC1Q15751 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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HERC1Q15751 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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HERC1Q15751 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
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HERC1Q15751 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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HERC1Q15751 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
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HERC1Q15751 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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