Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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