Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PRPF4BQ13523 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PRPF4BQ13523 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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