Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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