Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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KCNMA1Q12791 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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KCNMA1Q12791 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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