Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRGP23470 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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PTPRGP23470 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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PTPRGP23470 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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PTPRGP23470 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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PTPRGP23470 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRGP23470 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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