Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms