Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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