Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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