Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms