Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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