Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
TRADDQ15628 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
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TRADDQ15628 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
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TRADDQ15628 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
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TRADDQ15628 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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TRADDQ15628 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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TRADDQ15628 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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TRADDQ15628 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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TRADDQ15628 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRADDQ15628 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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