Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms