Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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