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| SEMA3A | Q14563 | MIR1251-201 | ENST00000408552 | 70 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP317-201 | ENST00000410176 | 116 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP311-201 | ENST00000411290 | 116 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL359704.1-201 | ENST00000411586 | 781 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | SEC23A-202 | ENST00000537403 | 4215 nt | TSL 2 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SYNE2-202 | ENST00000344113 | 21777 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR10D3-203 | ENST00000641546 | 3566 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC092326.2-201 | ENST00000624772 | 1561 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FRYL-205 | ENST00000503238 | 11103 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FAM71D-211 | ENST00000612183 | 1790 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PCDH15-208 | ENST00000395432 | 6901 nt | TSL 5 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MUC7-201 | ENST00000304887 | 2443 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FRG1BP-201 | ENST00000278882 | 761 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EDDM3A-201 | ENST00000326842 | 927 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.38-201 | ENST00000362617 | 102 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP295-201 | ENST00000362655 | 121 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU5A-6P-201 | ENST00000384136 | 116 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | ACTR3P3-201 | ENST00000480448 | 893 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091951.2-201 | ENST00000500762 | 203 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008628.2-201 | ENST00000502605 | 298 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CSN1S1-202 | ENST00000505782 | 871 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CSN1S1-204 | ENST00000507772 | 895 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR2114-201 | ENST00000516645 | 80 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC013762.1-201 | ENST00000531136 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC109635.4-202 | ENST00000531666 | 412 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GLYCAM1-201 | ENST00000546596 | 285 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | YPEL5P3-201 | ENST00000547227 | 352 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MEG8-218 | ENST00000556720 | 456 nt | TSL 3 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC006504.3-201 | ENST00000586818 | 523 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01905-206 | ENST00000593180 | 524 nt | TSL 2 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL161729.4-201 | ENST00000604650 | 476 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC128687.2-201 | ENST00000609657 | 566 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL109811.3-202 | ENST00000612387 | 651 nt | TSL 3 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008162.2-201 | ENST00000613352 | 291 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL158209.2-201 | ENST00000619266 | 216 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | XIST_intron.1-201 | ENST00000619444 | 68 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC124864.2-201 | ENST00000624736 | 186 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |