Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms