Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
APOFQ13790 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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