Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms