Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRPF4BQ13523 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms