Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.1 ms