Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATMQ13315 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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