Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IFFO1Q0D2I5 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms