Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CAPN6Q9Y6Q1 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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