Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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