Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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ZBED3Q96IU2 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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