Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 CRYGA-201ENST00000304502 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP72-201ENST00000362327 292 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 DBIL5P-202ENST00000453414 250 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SL587P-201ENST00000459853 281 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.3 ms