Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
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