Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HNF4GQ14541 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms