Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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ITGB3BPQ13352 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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ITGB3BPQ13352 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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ITGB3BPQ13352 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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ITGB3BPQ13352 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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ITGB3BPQ13352 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
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ITGB3BPQ13352 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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ITGB3BPQ13352 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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ITGB3BPQ13352 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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ITGB3BPQ13352 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
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