Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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