Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms