Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms