Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
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