Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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FAM53CQ9NYF3 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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FAM53CQ9NYF3 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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FAM53CQ9NYF3 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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